9月8日，北方东线战场，法军头子尼格里向谅山大举进犯。由于清军在夏季因水土不服和补给问题撤回广西，法军得以轻而易举进占谅山。
占领谅山后，尼格里认为北线清军已经不再构成威胁，随即率兵直扑镇南关。镇南关守将杨玉科与法军大战，不幸中炮身亡。广西巡抚潘鼎新仓皇逃往龙州。
守将身亡、大军溃散、巡抚逃脱。这在尼格里看来，清军已经完全被击溃，所以大意之下，尼格里犯了一个关键性的错误。
他没有在镇南关上放置重兵，而是将主要兵力退往关南15里的文渊。尼格里计划稍作修整后，由这里出发，直扑广西龙州。
而就在尼格里在文渊修整的时候，清军关键的几支队伍赶到了镇南关。
冯子材字南干，号萃亭，因此，他的队伍就称作‘萃军’。徐延旭、黄桂兰北宁大败后，已经68岁的冯子材再次受命总领广西南部军务，他遂以“不当兵保家卫国，老番打来了，就要当亡国奴”为口号，在钦廉、上思、龙州一带征募了十八个营、约九千余人。
谅山、镇南关相继失陷后，冯子材紧急率领‘萃军’赶到，在勘察完战场形势后，冯子材决定在关前隘地区依托有利地形，构筑坚固防御阵地。
关前隘在镇南关以北约4公里处，系镇南关通往内地之要冲，东西山岭对峙，中间有一条长2公里多、宽1公里多的盆谷，地势险要，易守难攻。
冯子材亲督士卒用土石筑起一道长1.5公里、高7尺、宽4尺的土石长墙，横跨于东西山岭之间，墙外挖成深4尺的壕堑，并在东、西山岭修建堡垒多座，形成一个完备的山地防御阵地体系。
于此同时，广西提督苏元春率桂军18营、提督王孝祺率8营共万余人也赶到了镇南关以北。另有王德榜率领10营湘军屯关外东南的油隘。
9月10日，幕府。
此处距离镇南关约十里，因为镇南关已失，这里暂时成了清军诸将的临时营地。此时，因为潘鼎新已经逃亡，作为前敌职位最高的文官，广西按察使李秉衡向各军提督发出了邀请，齐集幕府商讨下一步对策。
“所谓蛇无头不行，如今潘扶台不在，诸路大军云集，外有强敌窥伺，征战只在朝夕，为保战胜，应当有一名主帅居中协调指挥。今日请大家来，就是要推举一名各军总领，以带领大家共同迎敌。”
看了看各怀心事的几位将领，李秉衡首先道：“我先声明，本官不懂战阵军事，无法指挥，所以这军前总领一事不要找我。我只负责给诸位将军供给粮秣饷械。”
见李秉衡首先把自己摘了出去，王孝祺出来道：“我等众人，只有冯公德高望重，可以服众，所以兄弟我推举冯公总领各军。”
李秉衡立刻道：“本官也赞同南干兄为总领。”
见在座五名三品以上官员中，两名支持冯子材，作为湘军统帅，王德榜自然不愿意听从淮系的苏元春的指挥，因此也道：“兄弟也赞同冯公。”
剩下苏元春，不同意也得同意了。
于是，在众人的推举下，冯子材为前敌主帅，统一指挥协调各军的行动。
冯子材当仁不让，获得指挥权后，立刻就命人拿来地图，开始分配防御阵地。
“关前隘正对着镇南关，如果法军来袭，压力最重。这里就交给我‘萃军’来守，不过还请王大人的‘勤军’八营给我做后盾。”
王孝祺起身道：“单凭将军吩咐。”
谢过了王孝祺，冯子材继续道：“朗清兄的楚军六营布置在关前隘的左翼，防守镇南关东面的油隘。右翼有杨瑞山率领的萃军五营防守镇南关西面的扣波。另外，请朗清兄麾下副将魏刚率领的鄂军四营守艽封。此为第一梯队，共计三十一营一万余人。”
王德榜、杨瑞山等人一一领了军令，冯子材继续道：“除此之外，请提督苏大人带‘毅新军’八营和总兵陈嘉的‘镇南军’八营驻扎在幕府，作为第二梯队。以蒋宗汉、方以升率领的‘广武军’十四营驻扎在关前隘四十里之凭详，作为第三梯队。另外，请李大人帮忙传信，请马盛治马大人之六营、唐景崧唐大人之亲军四营驻守在高平、牧马。以为呼应。”
冯子材的一番布置既集中重兵在正面阻攻入侵之敌，又在两侧配置了较强的掩护夹击力量；既能防敌迁迥抄袭，又可支援正面作战。并巧妙地利用险要地形，避敌炮火猛烈之长，补已枪炮窳劣之短。在镇南关前后形成了一个多层次、多梯队、大纵深的坚固防御体系。
布置完毕后，除了不在现场的马盛治、唐景崧外，众人都心服口服。李秉衡这才长出了一口气，放心地说：“吾可立于不败矣！”
在广西清军开始调兵遣将，忙着布置新的防御阵地的同时，北宁法军统帅波里叶再次率领七千大军离开了北宁，沿安丰、达府，一路杀奔太原而来。
9月15日，波里叶兵临太原城下。
黑旗军早已在太原布置好了防御。在此之前，连美已经带着三千精兵抄小路前往北宁，同时，吴凤典也同样带着精兵三千绕到太原外围，准备袭扰法军后防炮兵阵地和辎重、补给。此时在太原城内的，是刘永福亲自指挥的两千黑旗军，以及岑毓宝、丁槐指挥的滇军两旅，共一万四千人。
波里叶知道自己的优势是什么，所以一上来，他就利用所有的大炮对着太原猛轰。